ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง

เทคนิคปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส (Polymerase Chain Reaction) เป็นเทคโนโลยี ที่ใช้ในการศึกษาทางอณูพันธุศาสตร์ ในการเพิ่มจำนวน ดีเอ็นเอที่ต้องการศึกษาอย่างจำเพาะในหลอดทดลองให้มีจำนวนมากในระยะเวลาอันสั้น โดยอาศัยเครื่องปรับเปลี่ยนอุณหภูมิให้เหมาะสมตาม ขั้นตอนปฏิกิริยา PCR  3 ขั้นตอน

1) Denaturation เป็นขั้นตอนการคลายเกลียวของสายดีเอ็นเอ

2) Annealing เป็นขั้นตอนการจับของ Primer กับสายดีเอ็นเอต้นแบบ

3) Extension เป็นขั้นตอนการสร้างสายดีเอ็นเอสายใหม่ โดยใช้เอนไซม์ DNA polymerase

ทางบริษัท ไบโอแอคทีฟ จำกัด มีผลิตภัณฑ์ เครื่อง Thermal Cycler ประสิทธิภาพสูง

  • ความจุ 96 หลุม ของหลอดขนาด 0.2 มิลลิลิตร
  • ควบคุมอุณหภูมิได้ในช่วง 0 – 99.9 องศาเซลเซียส
  • Uniformity น้อยกว่า ­+0.3 องศาเซลเซียส
  • สามารถตั้งค่าอุณหภูมิแบบ Gradient ได้
  • หน้าจอของเครื่องเป็นหน้าจอสี มีขนาดใหญ่ไม่น้อยกว่า 7 นิ้ว
  • ควบคุมด้วยระบบสัมผัส
  • มีระบบ WIFI และสามารถต่อเชื่อมเพื่อควบคุมการทำงานแบบ remote จาก Smart phone ได้

นอกจากนี้ ทางบริษัทฯ ยังมีจำหน่าย เครื่องเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรม ชนิด Real-Time PCR คุณภาพสูง จากยุโรป และ สหรัฐอเมริกา โดยมีทีมผู้เชียวชาญด้านเทคนิคคอยให้คำแนะนำรวมไปถึงทีมช่างบริการ (Service Engineer) ที่ให้บริการท่านแบบครบวงจร

ปฏิกิริยาลูกโซ่พอลิเมอเรส (อังกฤษ: Polymerase chain reaction; ตัวย่อ: PCR) เป็นกระบวนการสังเคราะห์ชิ้นส่วนดีเอ็นเอในหลอดทดลอง ซึ่งกระบวนการนี้เลียนแบบกระบวนการสังเคราะห์ดีเอ็นเอในสิ่งมีชีวิต ผู้คิดค้นเทคนิคพีซีอาร์ คือ Kary Mullis พีซีอาร์ประกอบไปด้วยขั้นตอนต่าง ๆ ดังต่อไปนี้

ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง

การแยกสายดีเอ็นเอเกลียวคู่ออกจากกัน (Denaturation) ใช้อุณหภูมิ ประมาณ 94 องศาเซลเซียส เมื่อเริ่มต้นดีเอ็นเอแม่แบบ จะอยู่ในลักษณะที่เป็นเกลียวคู่ เมื่อเพิ่มอุณหภูมิถึงประมาณ 94 องศาเซลเซียส จะทำให้พันธะไฮโดรเจนระหว่างคู่เบสของดีเอ็นเอถูกทำลาย ทำให้เส้นดีเอ็นเอแยกออกจากกัน โดยขั้นตอนนี้จะแตกต่างจากการสังเคราะห์ดีเอ็นเอในธรรมชาติ คือ ในสิ่งมีชีวิติจะมีเอนไซม์เฮลิเคส (Helicase) ช่วยในการแยกสายและคลายเกลียวดีเอ็นเอ
การจับของไพร์เมอร์กับดีเอ็นเอแม่แบบ (Annealing) ใช้อุณหภูมิประมาณ 40-62 องศาเซลเซียส เมื่อแยกสายดีเอ็นเอออกจากกันแล้ว จะลดอุณหภูมิลงเหลือ 40-62 องศาเซลเซียส เพื่อให้ดีเอ็นเอสังเคราะห์ขนาดสั้นประมาณ 15-25 เบส ที่เรียกว่า ไพร์เมอร์ (Primer) เข้ามาจับบริเวณที่มีลำดับเบสคู่สมกัน ในการสังเคราะห์ดีเอ็นเอ ไม่สามารถที่จะเริ่มจากศูนย์ได้เนื่องจากเอ็นไซม์ดีเอ็นเอพอลิเมอร์เรส (DNA polymerase) ต้องการปลาย-OH ทางด้าน 3'เพื่อนำ นิวคลีโอไทด์ตัวต่อมาต่อ ซึ่งในสิ่งมีชีวิตจะมีเอ็นไซม์ที่มีชื่อว่า ไพรเมส (Primase) เป็นตัวสร้างอาร์เอ็นเอไพรเมอร์ขึ้น
การสังเคราะห์ดีเอ็นเอสายใหม่ต่อจากไพรเมอร์ (Extension) ใช้อุณหภูมิ ประมาณ 68-72 องศาเซลเซียส ในขั้นตอนนี้จะเป็นการสร้างสายดีเอ็นเอต่อจากไพร์เมอร์ โดยอุณหภูมิที่ใช้จะพอเหมาะกับ การทำงานของ Taq DNA polymerase

องค์ประกอบที่สำคัญในการทำ PCR ได้แก่

-ดีเอ็นเอแม่แบบ (Template DNA)
-ไพรเมอร์ Primer
-เอ็นไซม์DNA Polymerase ชนิดทนความร้อน (Taq DNA polymerase)
-Deoxy nucleotide triphosphate(dNTP)
-บัฟเฟอร์สำหรับเอ็นไซม์ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส (PCR Buffer)
-แมกนีเซียมคลอไรด์(MgCl2)
-เครื่องมือที่สำคัญในการทำพีซีอาร์ได้แก่ Thermal cycler หรือ PCR machine

ข้อมูลจากวิกิพีเดีย สารานุกรมเสรี

 (Ref:https://www.youtube.com/watch?v=iQsu3Kz9NYo)

෤�Ԥ PCR 㹡�������ӹǹ DNA ����ԹԨ����ä�ҧ��Դ���������ѧ�������ѹ������ ������� ���� Deoxyribonucleic (DNA) ������ѹ��������˹������Ǻ�����������ʹ�ѡɳ���ҧ� �ͧ��������Ե �������������Сͺ����˹�����������ҹ������¡��� ���Ǥ����䷴�� �ѹ���ش�ͧ���š�����࿵ ������ྐྵ�� �����������������ѵ�����ҧ���� ��ʔ 1 ��� ������������� 4 ��Դ��� adenine (A) , guanine (G) , cytosine (C) , thymine (T)�ѡɳ��ç���ҧ�ͧ���������Сͺ����ҡ����ش��Ǥ����䷴� 2 ���������ѹ��������ѹ���ѡɳ��������������ѹ����¹ ������������§�������������������� ���������˹������ִ�Ѻ�����ҧ�������ͧ ��л�ҡ���������ǹ������� A ���Ѻ������ҧ�ѹ�СѺ�� T �����ǹ������� G ���Ѻ����� C �������Ѻ����ѹ������¡������������ (�ѧ�ʴ���Ҿ��� 1) ���������ǹ����������������ͧ�������������ͧ ��չ� (gene) �������ǹ�����è�����������Ѻ������ҧ�õչ��Դ���Դ˹�� ���չ�����ҧ�ѹ���������˹�����������������§���Ѻ�ͧ��������ѹᵡ��ҧ�ѹ�

��������� ����ö�������������ѹ��������

��� �.�. 2513 ������������������������ҧ��Դ������ѹ����������������� RNA ���� Ribonucleic acid) ��������������͡�����ҡ���������������������������������ӹǹ���������������ҹ�� ������ҧ��������������ѹ����������������� ���� ����������ͪ������������˵��ͧ�ä�ʹ��������������������١�͡�������ҡ������������������ʹ�������ҧ�õչ����������ʹ�����ҧ�ѹ�������͡�����ѡɳ�����͡�ͧ��������Ե��������� ��Сͺ������Ǥ����䷴�������¡Ѻ������� ��������ᵡ��ҧ���ǹ�ͧ������ྐྵ�ʫ������������������ deoxyribose ��ǹ��������������Դ ribose ������������������������Сͺ������ 4 ��Դ���ѹ ������ 3 ��Դ�������͹�Ѻ������� ��� A, G, C ����������ҧ�Ѻ���������� uracil (U) ��� u ���Ѻ���Ѻ�� A (᷹�� T ��������)

������

��� DNA ������������ѹ�������ͧ��������Ե ������Ҵ���ᵡ��ҧ�ѹ�ҡ��ó��ͧ����������Ҩ�ը��� (genome) �����������ѹ�������������� DNA ���� RNA ������ ����Ҩ������������������������������� (linear) ǧ��ǹ (circular) ����������¡�ѹ (segments) �����ҧ�ҡ�����ͧẤ�����������������Ե����٧ ��������õչ�����Ѻ�ѹ����Ѻ��� DNA ������ٻ��ҧ������Ѵ ������¡��������� (chromosome) (�Ҿ��� 2) ����Ấ������ ���������� ��Сͺ���� DNA �������������Դǧ��ǹ�Ѻ�������Ѻ�õչ������Դ ����������¡�����Ǥ����´� (nucleoid) ������������������������������������������Ե����٧ ��� DNA ��������ѡɳ�����Ѻ����Ѻ���⵹ (histone) ����õչ��Դ���� ��������ѹ���˴����ͧ��� DNA �����������ö��è�������ǹ���������ͧ������ �͡�ҡ������������ ���������Ե����٧�ѧ���չ����������ǹ�ͧ organelle ���� ����ת�����չ���������͹���� (mitochondria) �������þ��� (chloroplast) �ա��ǹ˹������

෤�Ԥ Polymerase Chain Reaction (PCR)

Polymerase Chain Reaction ���� (PCR) ��෤�Ԥ����Ѻ��������ҳ����������������ѡ��� DNA Replication ���������ѧ����������� ��� �� ������� �ҡ ���������Ẻ���ʹ���ͧ�������������ѹ�����������������������Դ�������ҹ��� ෤�Ԥ����Ѳ������������ �.�. 2528 �� Kary Mullis ��������������ѷ Cetus Corporation �ش���ͧ෤�Ԥ PCR ��� ����ö��������ҳ������� �����ҧ੾���������������͹������ҹ����������������� ���֧�Ѩ�غѹ���෤�Ԥ PCR ���Ѻ�����Ѻ��ا����Ѳ������� � ��ҹ����з�����Ѻ�������Ѻ�����෤���������Ӥѭ�ҡ����ҹ��ҹͳ�������š�� ����ö���������ª������駡Ѻ�ҹ�Ԩ���ҧ������š������ѹ�����ǡ��� �� �����������ҳ�չ (gene cloning) ��������������Ѻ���ͧ�չ (gene sequencing) ������ҧ �� ��� �� �Դ��� (DNA probe) �������Ԩ������ء�� �� ����֡������ʴ��͡�ͧ�չ�ҡ mRNA ������ҧ�չ�����ѹ��� (in vitro mutagenesis) �����������˹������ѹ������չ (point mutations and deletions) ����෤�Ԥ PCR 㹡�������ӹǹ DNA
ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง

�Ҿ��� 1 ͧ���Сͺ����ç���ҧ�ͧ DNA ��èѺ���ѹ�ͧ�ʤ�����ͧ��� DNA �ͧ��·�������ѡɳ�����Ǥ�� ��Ѻ��ȷҧ
(����� : Alberts ����, 1983)
ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง

�Ҿ��� 2 ��� DNA ����Ǥ��ѹ�Ѻ�õչ���˴�����������ҵչ������������������������
(����� : Freifelder, 1985)

��ѡ��âͧ PCR

����ѡ�������ҹ�����ѧ������������� ��������ҡ���������� �������Ẻ˹����������͹��� DNA poloymerase ������ѹ��������������Դ��ҡ������� �������֡�������������Ѻ�� �� PCR ����ö�ѧ��������������������� 2 ���������ѹ ����������� (primer) 1 ��� ��ԡ����� PCR �� 3 ����͹ �����ع���¹ ������ͧ�ѹ� ���������������������ͧ��������͹����á ���¡��� denaturing ������¡����� ��� �� �������Ẻ�ҡ��Ҿ����������� ������������������س������٧ 92-95o��������ͧ���¡��� annealing ������͹���Ŵ�س�����ŧ����Ѵ���������� ������� ��� �� ������ � (��Сͺ������Ǥ����䷴�ӹǹ 14-13 ��) ��������Ѻ ����������Ѻ�� ��� �� �������Ẻ�Ѻ����ѹ ����������س��������ǧ 37-60o ������� 3 ���¡��� extension ������͹����ѧ�������� ��� �� ����������ѧ����������ҡ��ǹ���� 5 �ͧ������� ������������������ �������Ẻ��������������������ҹ�ͧ����������������������� (DNA polymerase) ���������������ö���ҹ��������ش����س����� 72-75o � �͹������������������������������� �س���ѵ������������������ͧ��ԡ����� ��ʹ����������͹
ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง
�Ҿ��� 3 ��ѡ����������͹�����������ҳ������� ����෤�Ԥ PCR
(����� : PE applied Biosystems)�ҡ����͹��� 1-3 ����Ѻ���ӹǹ 1 �ͺ (one cycle) ���������Ե�����������������������Ѻ����������Ѻ��������������Ẻ����������ͧ��� ������Ѵ����Դ��ԡ������١���ҡ������ 1 �֧ 3 ��ع���¹��ա���� � �ͺ����������ҳ��������� �ҡ��� ����ҳ�����ԡ����� 20 �ͺ ����ö��������ҳ����������������������� 100,000 ���

����������������ͧ���ԡ����� PCR

���ͧ�ҡ����� PCR ��������ҧ���������� ����������ʹ���ͧ �֧��ͧ�����������������������������������ͧ �����������������ҧ���������������� �����������ͧ����ԡ����� PCR ���ѧ�������
  1.  Deoxynucleotides (dNTPs) ����Ǥ����䷴� �����˹�����������Ѻ����ѧ��������������������
  2.  DNA polymerase ���͹�������Ѻ�ѧ�������������������������ԡ���������������Ǥ����䷴�������ҡѺ�������
  3.  Primer ���������������������� � ��������Ѻ����������Ѻ��������������Ẻ�ͧ����ѧ������ ������ PCR �֧��ͧ��Һ���Ѻ���ͧ������������ͧ����������ӹǹ �������������ҧ����������
  4.  PCR buffer ��������������Ǻ���������ͧ�������ԡ��������������� �� pH ���������ҧ � �������ͧ��͹������������� (Mg++) ��������
  5.  Template ������������Ẻ�����չ��ǹ�����ͧ�����������ҳ ������������ҧ������� �����ͧ���������Ǩ��������������
�������������ǹ����ͧ��ԡ����� PCR ������ѹ������ʹ���ͧ�������ҵ���� 20-100 �����Ե� ���������ʹ��ǹ���������������ͧ�Ǻ����س�����������¡��� DNA thermal cycler (�������¡�������ͧ Pcr) �����Ѻ�س��������������������˹� ���Դ����ѧ��������������������������ʹ ������Դ��ԡ��������ú�ͺ���������������˹���������Ե������� ��Ҵ�����ͧ������ӹǹ�ҡ

����ͧ��������ҳ������� (PCR machine)

����ͧ Thermal cycler ���� PCR machine ������ͧ������������� PCR �������ͧ�������������Ẻ��������к���鹡Ѻ����͡Ẻ�������Դ���ͧ����ѷ �����Ե ����Ӥѭ�����ͧ����ö��Ѻ����¹�س�������������͹������������������ҹ��ع���¹�ѹ���� � �ͺ����������������ҹ������������¹�ŧ�س����� ���������͹��������������ҹ�ѡ����������������������� denaturing annealing ��� extension �������ǧ 15 �Թҷ� �֧ 10 �ҷ� �ѧ��������������ҳ����������Ը� PCR 25-40 �ͺ ������������ҳ 1.5-5 �������

���������������Ե��������ҡ��ԡ����� PCR

�����������Դ�ҡ��ԡ����� PCR ���ʹ��ͧ���������ö�ͧ��������������� �ѧ���������Ǩ�������������Ե����ͧ��������ҧ����� PCR ���¡�������������෤�Ԥ������¡��� agarose gel electrophoresis ���������¡��������������������������� (Agarose gel) �������ҧ��������������ö����͹���������������Ѻ��Ҵ�ͧ������������������������ �����������¡���Ը��������ö�ͧ������������������������� ��������ͧ�ʧ������͡Ѻ�ʧ�ص��������ŵ ��������ᶺ����������ͧ�ʧ������� (�Ҿ��� 4)
ปฏิกิริยา PCR ประกอบด้วยกี่ขั้นตอน อะไรบ้าง
�Ҿ��� 4 ᶺ�����������¡����������Ը� agarose gel electrophoresis
������������� ethidium bromide �����Ҿ������ʧ ultraviolet

����ª���ͧ PCR ������Ǩ�ԹԨ����ä

�Ѩ�غѹ����Ѻ����� PCR ��෤�Ԥ�Ӥѭ�ҡ��ҹͳ�������š�� ���������ҹ����ҹ���ͧ��Ժѵ��������֧�������ء�����ҧ���ᾷ���������ɵ�����ö�������ԹԨ����ä��ҧ � ����ä�Դ��������ä�ҡ�ѹ������ �֡�������ѹ�����������ѹ����ͧ�ѹ�����������չ ��Ἱ����չ����֡�����Ѻ���ͧ�չ�ͧ��������Ե���ء��Դ ���������ͧ���ҡ෤�Ԥ�������ö�����ӹǹ����������ʹ��֡�����������ҳ�ҡ������ѹ�Ǵ���� �����෤�Ԥ���������������ª���ͧ PCR �ҧ��ҹ���ᾷ�� ���� �����Ǩ�ԹԨ����ä�������Ǩ���������������Ấ��������������˵��ͧ�ä (�� �ä�ʹ��,�ѳ�ä,��������) �����Ǩ���չ�������� (�� ����������,�����������˭�) �������ª���ͧ PCR �ҧ���ᾷ�������������������ԹԨ����ä������ͧ�ѹ����ѡ��������ҧ������Է���Ҿ�ҡ�������ҧ��ҹ����ɵ� PCR �����ҷ�ҡ��ҹ��ҹ�����Ѻ��ا�ѹ����ת �����Ǩ�ͺ����ѹ����ת �����Ǩ�ԹԨ����ä����ѹ����ת��ҹ�ҹ�ä ����֡����������ѹ�������ҧ�ת�Ѻ�����ä�������֡���չ�Ѻ������ � �ͧ�ת��������ä �������ʴ��͡�ͧ�չ���������� ���෤�Ԥ PCR ���������������֧�ѹ�������ͧ�����ä�ת��� �ת����� ��ʹ����������������ͧ�ѹ�ӨѴ�ä�ת����Դ�ҡ������ Ấ������ �������� �����������˵��ä��� �������෤�Ԥ PCR ���١��������ص��ˡ����������§��� ����� �ص��ˡ������͡�������������Ѻ������� 4-5 ������ҹ�ҷ����� ����Ѩ�غѹ����ɵ�����������ʺ�ѭ���ҡ�ä�кҴ��������§��� ��������������Ե������͡�������������٭����������֧���� 1-2 ������ҹ�ҷ ���˵��ͧ�ä�кҴ��������� ��ǹ�˭��Դ�ҡ��������������ͧ��෤�Ԥ PCR ������Ǩ�ͺ ���������ö��ͧ�ѹ�������кҴ�ͧ�ä���ѹ��ǧ�� �͡�ҡ�������Ѵ���͡����ѹ�������������������������ѹ�������������û�ǹ�ѹ�ء��� (genetic diversity ���� Variation) �٧���������ö���Թ������������Ը�����Ѵ���͡���������Է���Ҿ ����١��ͧ�֧�дѺ �ѹ������
��������ͺ������ҡ ��Ƿ.